Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LmnaP48678 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LmnaP48678 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LmnaP48678 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LmnaP48678 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LmnaP48678 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LmnaP48678 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LmnaP48678 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms