Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VdrP48281 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VdrP48281 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VdrP48281 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VdrP48281 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VdrP48281 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VdrP48281 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VdrP48281 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VdrP48281 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VdrP48281 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VdrP48281 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VdrP48281 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VdrP48281 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VdrP48281 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VdrP48281 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VdrP48281 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VdrP48281 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VdrP48281 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VdrP48281 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VdrP48281 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VdrP48281 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VdrP48281 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VdrP48281 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VdrP48281 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VdrP48281 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VdrP48281 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VdrP48281 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VdrP48281 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VdrP48281 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VdrP48281 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VdrP48281 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VdrP48281 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VdrP48281 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VdrP48281 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VdrP48281 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VdrP48281 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VdrP48281 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VdrP48281 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VdrP48281 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VdrP48281 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VdrP48281 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VdrP48281 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VdrP48281 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VdrP48281 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VdrP48281 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VdrP48281 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VdrP48281 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VdrP48281 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VdrP48281 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VdrP48281 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VdrP48281 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VdrP48281 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VdrP48281 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VdrP48281 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VdrP48281 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VdrP48281 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VdrP48281 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VdrP48281 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VdrP48281 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VdrP48281 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VdrP48281 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VdrP48281 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VdrP48281 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VdrP48281 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VdrP48281 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VdrP48281 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VdrP48281 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VdrP48281 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VdrP48281 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VdrP48281 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VdrP48281 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VdrP48281 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VdrP48281 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VdrP48281 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VdrP48281 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VdrP48281 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VdrP48281 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VdrP48281 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VdrP48281 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VdrP48281 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VdrP48281 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VdrP48281 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VdrP48281 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VdrP48281 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VdrP48281 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VdrP48281 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VdrP48281 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VdrP48281 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VdrP48281 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VdrP48281 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VdrP48281 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VdrP48281 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VdrP48281 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VdrP48281 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VdrP48281 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VdrP48281 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VdrP48281 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VdrP48281 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VdrP48281 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VdrP48281 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms