Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gbx2P48031 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gbx2P48031 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gbx2P48031 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gbx2P48031 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gbx2P48031 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gbx2P48031 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gbx2P48031 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gbx2P48031 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gbx2P48031 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gbx2P48031 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gbx2P48031 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gbx2P48031 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gbx2P48031 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gbx2P48031 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gbx2P48031 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gbx2P48031 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gbx2P48031 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gbx2P48031 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gbx2P48031 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gbx2P48031 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gbx2P48031 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gbx2P48031 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gbx2P48031 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gbx2P48031 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gbx2P48031 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gbx2P48031 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gbx2P48031 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gbx2P48031 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gbx2P48031 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gbx2P48031 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbx2P48031 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms