Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rph3aP47708 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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