Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TfamP40630 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TfamP40630 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TfamP40630 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TfamP40630 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TfamP40630 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TfamP40630 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TfamP40630 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TfamP40630 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TfamP40630 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TfamP40630 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TfamP40630 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TfamP40630 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TfamP40630 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TfamP40630 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TfamP40630 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TfamP40630 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TfamP40630 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TfamP40630 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TfamP40630 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TfamP40630 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TfamP40630 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TfamP40630 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TfamP40630 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TfamP40630 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TfamP40630 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TfamP40630 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TfamP40630 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TfamP40630 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TfamP40630 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TfamP40630 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TfamP40630 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TfamP40630 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TfamP40630 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TfamP40630 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TfamP40630 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TfamP40630 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TfamP40630 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TfamP40630 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TfamP40630 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TfamP40630 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TfamP40630 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TfamP40630 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TfamP40630 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TfamP40630 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TfamP40630 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TfamP40630 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TfamP40630 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TfamP40630 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TfamP40630 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TfamP40630 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TfamP40630 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TfamP40630 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TfamP40630 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TfamP40630 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TfamP40630 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TfamP40630 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TfamP40630 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TfamP40630 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TfamP40630 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TfamP40630 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TfamP40630 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TfamP40630 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TfamP40630 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TfamP40630 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TfamP40630 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TfamP40630 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TfamP40630 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TfamP40630 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TfamP40630 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TfamP40630 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TfamP40630 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TfamP40630 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TfamP40630 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TfamP40630 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TfamP40630 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TfamP40630 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TfamP40630 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TfamP40630 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TfamP40630 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TfamP40630 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TfamP40630 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TfamP40630 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TfamP40630 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TfamP40630 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TfamP40630 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TfamP40630 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TfamP40630 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TfamP40630 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TfamP40630 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TfamP40630 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TfamP40630 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TfamP40630 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TfamP40630 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TfamP40630 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TfamP40630 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TfamP40630 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TfamP40630 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TfamP40630 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TfamP40630 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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