Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fen1P39749 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fen1P39749 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fen1P39749 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fen1P39749 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fen1P39749 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fen1P39749 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms