Protein–RNA interactions for Protein: P38060

Hmgcl, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgclP38060 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HmgclP38060 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgclP38060 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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HmgclP38060 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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HmgclP38060 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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HmgclP38060 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgclP38060 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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HmgclP38060 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HmgclP38060 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HmgclP38060 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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