Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpargP37238 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpargP37238 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpargP37238 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PpargP37238 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpargP37238 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpargP37238 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpargP37238 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpargP37238 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpargP37238 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpargP37238 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpargP37238 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpargP37238 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpargP37238 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpargP37238 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpargP37238 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpargP37238 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpargP37238 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpargP37238 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpargP37238 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpargP37238 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpargP37238 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpargP37238 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpargP37238 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpargP37238 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpargP37238 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PpargP37238 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpargP37238 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpargP37238 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpargP37238 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpargP37238 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpargP37238 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpargP37238 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpargP37238 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpargP37238 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpargP37238 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpargP37238 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpargP37238 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpargP37238 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpargP37238 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpargP37238 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpargP37238 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpargP37238 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpargP37238 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpargP37238 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpargP37238 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpargP37238 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpargP37238 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpargP37238 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpargP37238 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PpargP37238 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PpargP37238 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PpargP37238 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpargP37238 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PpargP37238 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpargP37238 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PpargP37238 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpargP37238 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpargP37238 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpargP37238 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpargP37238 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpargP37238 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpargP37238 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpargP37238 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpargP37238 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpargP37238 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpargP37238 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpargP37238 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpargP37238 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpargP37238 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpargP37238 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpargP37238 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpargP37238 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpargP37238 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpargP37238 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpargP37238 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpargP37238 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpargP37238 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpargP37238 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpargP37238 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpargP37238 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpargP37238 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpargP37238 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpargP37238 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpargP37238 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpargP37238 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpargP37238 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PpargP37238 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PpargP37238 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpargP37238 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpargP37238 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpargP37238 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpargP37238 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpargP37238 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpargP37238 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpargP37238 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpargP37238 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpargP37238 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpargP37238 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpargP37238 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms