Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc5P35689 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc5P35689 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc5P35689 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc5P35689 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc5P35689 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ercc5P35689 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms