Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfc1P35601 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfc1P35601 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms