Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms