Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnd1P30999 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnd1P30999 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms