Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VtnP29788 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VtnP29788 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VtnP29788 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VtnP29788 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VtnP29788 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VtnP29788 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VtnP29788 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VtnP29788 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VtnP29788 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VtnP29788 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VtnP29788 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VtnP29788 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VtnP29788 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VtnP29788 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VtnP29788 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VtnP29788 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VtnP29788 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VtnP29788 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VtnP29788 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VtnP29788 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VtnP29788 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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VtnP29788 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
VtnP29788 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VtnP29788 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VtnP29788 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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VtnP29788 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VtnP29788 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VtnP29788 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
VtnP29788 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VtnP29788 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VtnP29788 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VtnP29788 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VtnP29788 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VtnP29788 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VtnP29788 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VtnP29788 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VtnP29788 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VtnP29788 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VtnP29788 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VtnP29788 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VtnP29788 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VtnP29788 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VtnP29788 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VtnP29788 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VtnP29788 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
VtnP29788 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VtnP29788 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VtnP29788 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VtnP29788 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VtnP29788 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VtnP29788 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VtnP29788 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VtnP29788 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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