Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Hoxd10P28359 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Hoxd10P28359 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Hoxd10P28359 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Hoxd10P28359 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Hoxd10P28359 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Hoxd10P28359 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Hoxd10P28359 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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