Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms