Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vav1P27870 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vav1P27870 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vav1P27870 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vav1P27870 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vav1P27870 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vav1P27870 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vav1P27870 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vav1P27870 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav1P27870 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav1P27870 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav1P27870 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav1P27870 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav1P27870 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms