Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms