Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CftrP26361 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CftrP26361 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CftrP26361 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CftrP26361 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CftrP26361 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CftrP26361 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CftrP26361 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CftrP26361 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CftrP26361 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CftrP26361 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CftrP26361 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CftrP26361 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CftrP26361 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CftrP26361 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CftrP26361 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CftrP26361 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CftrP26361 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CftrP26361 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CftrP26361 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CftrP26361 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CftrP26361 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CftrP26361 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CftrP26361 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CftrP26361 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CftrP26361 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CftrP26361 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CftrP26361 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CftrP26361 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CftrP26361 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CftrP26361 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CftrP26361 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CftrP26361 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CftrP26361 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CftrP26361 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CftrP26361 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CftrP26361 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CftrP26361 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CftrP26361 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CftrP26361 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CftrP26361 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CftrP26361 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CftrP26361 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CftrP26361 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CftrP26361 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CftrP26361 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CftrP26361 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CftrP26361 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CftrP26361 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CftrP26361 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CftrP26361 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CftrP26361 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CftrP26361 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CftrP26361 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CftrP26361 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CftrP26361 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CftrP26361 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CftrP26361 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CftrP26361 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CftrP26361 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CftrP26361 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CftrP26361 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CftrP26361 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CftrP26361 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CftrP26361 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CftrP26361 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CftrP26361 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CftrP26361 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CftrP26361 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CftrP26361 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CftrP26361 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CftrP26361 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CftrP26361 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CftrP26361 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CftrP26361 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CftrP26361 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CftrP26361 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CftrP26361 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CftrP26361 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CftrP26361 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CftrP26361 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CftrP26361 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CftrP26361 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CftrP26361 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CftrP26361 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CftrP26361 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CftrP26361 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CftrP26361 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CftrP26361 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CftrP26361 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CftrP26361 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CftrP26361 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CftrP26361 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CftrP26361 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CftrP26361 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CftrP26361 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CftrP26361 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CftrP26361 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CftrP26361 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CftrP26361 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms