Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChgaP26339 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChgaP26339 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChgaP26339 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChgaP26339 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChgaP26339 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChgaP26339 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChgaP26339 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ChgaP26339 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChgaP26339 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms