Protein–RNA interactions for Protein: P23979

Htr3a, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3aP23979 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Htr3aP23979 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms