Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxd8P23463 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Hoxd8P23463 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Hoxd8P23463 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd8P23463 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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