Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ggta1P23336 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms