Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eif3aP23116 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms