Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RarbP22605 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RarbP22605 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RarbP22605 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RarbP22605 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RarbP22605 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RarbP22605 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RarbP22605 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RarbP22605 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RarbP22605 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RarbP22605 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RarbP22605 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RarbP22605 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RarbP22605 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RarbP22605 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RarbP22605 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RarbP22605 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RarbP22605 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RarbP22605 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RarbP22605 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RarbP22605 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RarbP22605 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RarbP22605 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RarbP22605 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RarbP22605 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RarbP22605 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RarbP22605 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RarbP22605 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RarbP22605 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RarbP22605 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RarbP22605 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RarbP22605 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RarbP22605 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RarbP22605 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RarbP22605 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RarbP22605 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RarbP22605 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RarbP22605 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RarbP22605 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RarbP22605 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RarbP22605 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RarbP22605 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RarbP22605 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RarbP22605 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RarbP22605 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RarbP22605 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RarbP22605 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RarbP22605 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RarbP22605 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RarbP22605 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RarbP22605 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RarbP22605 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RarbP22605 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RarbP22605 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RarbP22605 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RarbP22605 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RarbP22605 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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