Protein–RNA interactions for Protein: P22227

Zfp42, Zinc finger protein 42, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp42P22227 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Zfp42P22227 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp42P22227 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp42P22227 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp42P22227 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp42P22227 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp42P22227 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp42P22227 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp42P22227 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp42P22227 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp42P22227 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp42P22227 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp42P22227 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp42P22227 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp42P22227 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp42P22227 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp42P22227 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp42P22227 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp42P22227 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp42P22227 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp42P22227 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp42P22227 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp42P22227 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp42P22227 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp42P22227 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp42P22227 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp42P22227 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp42P22227 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp42P22227 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp42P22227 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp42P22227 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp42P22227 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Zfp42P22227 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp42P22227 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp42P22227 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp42P22227 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Zfp42P22227 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp42P22227 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp42P22227 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp42P22227 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp42P22227 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Zfp42P22227 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Zfp42P22227 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Zfp42P22227 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp42P22227 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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