Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SftpcP21841 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpcP21841 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpcP21841 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpcP21841 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
SftpcP21841 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms