Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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