Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P20040 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P20040 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P20040 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P20040 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P20040 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P20040 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P20040 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P20040 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P20040 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P20040 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P20040 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P20040 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P20040 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P20040 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P20040 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P20040 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P20040 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P20040 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P20040 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P20040 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P20040 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P20040 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P20040 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
P20040 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P20040 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P20040 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P20040 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
P20040 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P20040 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P20040 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P20040 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P20040 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P20040 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P20040 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P20040 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P20040 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P20040 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P20040 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P20040 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P20040 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P20040 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P20040 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P20040 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P20040 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P20040 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P20040 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P20040 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P20040 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P20040 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P20040 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P20040 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P20040 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P20040 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P20040 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P20040 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P20040 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms