Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ms4a1P19437 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms