Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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