Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifrd1P19182 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifrd1P19182 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms