Protein–RNA interactions for Protein: P19001

Krt19, Keratin, type I cytoskeletal 19, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt19P19001 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt19P19001 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt19P19001 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt19P19001 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt19P19001 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt19P19001 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt19P19001 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt19P19001 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms