Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
P18530 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P18530 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P18530 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P18530 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
P18530 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P18530 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
P18530 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P18530 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P18530 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P18530 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
P18530 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
P18530 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P18530 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P18530 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
P18530 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P18530 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P18530 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
P18530 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P18530 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P18530 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P18530 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
P18530 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P18530 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
P18530 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
P18530 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P18530 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P18530 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
P18530 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P18530 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P18530 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P18530 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P18530 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
P18530 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P18530 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P18530 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P18530 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P18530 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P18530 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P18530 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
P18530 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
P18530 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P18530 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P18530 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P18530 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
P18530 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
P18530 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P18530 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
P18530 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
P18530 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P18530 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P18530 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P18530 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P18530 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P18530 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P18530 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P18530 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
P18530 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P18530 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
P18530 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P18530 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P18530 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P18530 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P18530 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P18530 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P18530 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P18530 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P18530 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P18530 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P18530 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P18530 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P18530 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P18530 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P18530 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P18530 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P18530 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P18530 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P18530 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P18530 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P18530 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P18530 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P18530 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P18530 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P18530 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
P18530 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
P18530 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P18530 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P18530 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
P18530 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P18530 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P18530 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P18530 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P18530 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P18530 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P18530 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P18530 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P18530 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P18530 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P18530 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P18530 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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