Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
P18525 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18525 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18525 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18525 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
P18525 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18525 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18525 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18525 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18525 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18525 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18525 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18525 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18525 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18525 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18525 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18525 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18525 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18525 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18525 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18525 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18525 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18525 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18525 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
P18525 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18525 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18525 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18525 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18525 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18525 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18525 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18525 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18525 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18525 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18525 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18525 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
P18525 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18525 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
P18525 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
P18525 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18525 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18525 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18525 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18525 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18525 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18525 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18525 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18525 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18525 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18525 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18525 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18525 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18525 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18525 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18525 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18525 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18525 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18525 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18525 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18525 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18525 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18525 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
P18525 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
P18525 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18525 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18525 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18525 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18525 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18525 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18525 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18525 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18525 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18525 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18525 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P18525 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18525 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18525 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18525 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18525 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18525 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18525 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18525 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18525 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18525 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18525 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
P18525 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18525 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18525 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18525 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18525 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18525 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18525 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18525 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18525 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18525 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
P18525 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18525 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P18525 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
P18525 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P18525 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms