Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms