Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmnb1P14733 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lmnb1P14733 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lmnb1P14733 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms