Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrm1P12657 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms