Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa1P11477 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms