Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PolP11369 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PolP11369 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PolP11369 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PolP11369 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PolP11369 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolP11369 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolP11369 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolP11369 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolP11369 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolP11369 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolP11369 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolP11369 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolP11369 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolP11369 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolP11369 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolP11369 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolP11369 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolP11369 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolP11369 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolP11369 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolP11369 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolP11369 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolP11369 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolP11369 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolP11369 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolP11369 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolP11369 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PolP11369 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolP11369 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolP11369 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PolP11369 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP11369 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP11369 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP11369 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP11369 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP11369 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP11369 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP11369 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP11369 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP11369 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP11369 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP11369 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP11369 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP11369 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP11369 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP11369 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP11369 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP11369 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP11369 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP11369 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP11369 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP11369 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP11369 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP11369 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP11369 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP11369 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP11369 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PolP11369 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolP11369 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolP11369 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolP11369 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolP11369 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolP11369 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolP11369 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolP11369 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PolP11369 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolP11369 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolP11369 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PolP11369 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolP11369 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolP11369 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolP11369 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolP11369 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolP11369 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolP11369 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolP11369 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolP11369 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolP11369 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolP11369 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolP11369 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolP11369 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolP11369 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolP11369 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolP11369 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PolP11369 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolP11369 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolP11369 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolP11369 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolP11369 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolP11369 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PolP11369 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolP11369 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolP11369 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolP11369 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolP11369 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolP11369 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolP11369 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolP11369 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PolP11369 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms