Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prf1P10820 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prf1P10820 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prf1P10820 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prf1P10820 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prf1P10820 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prf1P10820 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms