Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P10404 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P10404 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P10404 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
P10404 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P10404 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P10404 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P10404 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P10404 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
P10404 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P10404 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P10404 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P10404 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
P10404 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
P10404 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P10404 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
P10404 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
P10404 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
P10404 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P10404 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P10404 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P10404 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
P10404 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P10404 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P10404 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
P10404 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
P10404 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
P10404 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
P10404 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
P10404 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
P10404 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
P10404 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
P10404 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
P10404 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
P10404 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
P10404 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
P10404 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
P10404 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
P10404 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
P10404 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
P10404 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P10404 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P10404 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P10404 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P10404 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P10404 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P10404 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P10404 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P10404 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P10404 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P10404 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P10404 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P10404 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
P10404 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P10404 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P10404 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P10404 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P10404 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
P10404 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P10404 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P10404 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
P10404 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P10404 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P10404 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P10404 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P10404 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P10404 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P10404 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P10404 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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P10404 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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