Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms