Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa6P09092 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms