Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spta1P08032 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Spta1P08032 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spta1P08032 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Spta1P08032 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Spta1P08032 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spta1P08032 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spta1P08032 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Spta1P08032 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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