Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtrP07309 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtrP07309 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtrP07309 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtrP07309 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TtrP07309 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TtrP07309 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtrP07309 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TtrP07309 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtrP07309 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TtrP07309 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtrP07309 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtrP07309 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtrP07309 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtrP07309 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtrP07309 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtrP07309 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtrP07309 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtrP07309 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtrP07309 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtrP07309 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtrP07309 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtrP07309 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtrP07309 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtrP07309 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtrP07309 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtrP07309 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtrP07309 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtrP07309 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtrP07309 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtrP07309 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtrP07309 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtrP07309 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtrP07309 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtrP07309 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TtrP07309 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtrP07309 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtrP07309 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtrP07309 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtrP07309 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtrP07309 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtrP07309 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtrP07309 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtrP07309 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtrP07309 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtrP07309 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtrP07309 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtrP07309 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtrP07309 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtrP07309 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtrP07309 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TtrP07309 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TtrP07309 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TtrP07309 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TtrP07309 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms