Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrygdP04342 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrygdP04342 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrygdP04342 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CrygdP04342 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrygdP04342 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CrygdP04342 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms