Protein–RNA interactions for Protein: P01823

Ig heavy chain V region 36-60, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01823 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01823 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01823 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01823 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01823 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01823 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01823 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01823 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01823 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01823 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01823 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01823 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01823 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01823 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01823 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01823 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01823 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01823 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01823 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01823 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01823 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01823 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01823 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01823 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01823 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01823 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01823 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01823 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01823 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01823 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01823 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01823 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01823 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01823 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01823 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01823 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01823 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01823 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01823 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01823 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01823 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01823 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01823 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01823 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01823 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01823 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01823 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01823 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01823 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01823 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01823 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01823 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01823 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01823 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01823 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms