Protein–RNA interactions for Protein: P01822

Ig heavy chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01822 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01822 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01822 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01822 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01822 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01822 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01822 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01822 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01822 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01822 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01822 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01822 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01822 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01822 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01822 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01822 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01822 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
P01822 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01822 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01822 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01822 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
P01822 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01822 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01822 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01822 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01822 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01822 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01822 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01822 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01822 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01822 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01822 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01822 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01822 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01822 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
P01822 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01822 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01822 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01822 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01822 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01822 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01822 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01822 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01822 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01822 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01822 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P01822 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01822 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01822 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01822 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01822 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01822 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01822 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01822 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01822 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01822 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01822 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01822 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01822 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01822 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01822 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01822 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01822 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01822 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01822 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01822 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01822 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01822 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01822 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01822 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01822 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01822 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01822 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01822 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01822 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01822 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01822 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01822 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01822 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01822 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01822 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01822 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01822 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01822 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01822 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01822 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01822 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01822 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01822 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01822 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01822 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01822 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01822 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01822 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01822 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01822 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01822 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01822 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01822 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01822 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms