Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnb1P01575 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms