Protein–RNA interactions for Protein: O88892

Serf1, Small EDRK-rich factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serf1O88892 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Serf1O88892 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Serf1O88892 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Serf1O88892 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Serf1O88892 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Serf1O88892 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Serf1O88892 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Serf1O88892 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Serf1O88892 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms